Nejlepší fakturační program pro OSVČ: poctivé srovnání

Stručně: pro většinu OSVČ, kterým klienti platí převodem, je nejbezpečnější volbou Fakturoid. iDoklad se hodí pro malé týmy, Vyfakturuj je nejlevnější start pro nové podnikatele, SuperFaktura má nejlevnější placený tarif s párováním plateb a POHODA nebo Money S3 dávají smysl, pokud chcete plnou daňovou evidenci na desktopu nebo je už používá vaše účetní. Jeden nejlepší fakturační program neexistuje. Existuje jen ten, který sedí na to, jak dostáváte zaplaceno, jestli jste plátce DPH a kdo vám vede účetnictví.

Upozornění předem: vyvíjím MoneySky, jeden z nástrojů níže. Dostává stejné zacházení jako ostatní, včetně slabin.

Jak vybrat: šest otázek, na kterých záleží

1. Kolik vás to bude stát při vaší velikosti?

Většina verzí zdarma končí kolem pěti odběratelů nebo kontaktů, takže stačí na vedlejšák, ne na podnikání na plný úvazek. Dívejte se na cenu tarifu, který budete opravdu potřebovat, ne na nejnižší: párování plateb a výstupy k DPH bývají o jeden až dva tarify výš. Roční platba a slevy pro začínající podnikatele umí první rok hodně zlevnit.

2. Platí vám převodem, nebo osobně?

EET 2.0 začíná 1. ledna 2027 (leden je zkušební, plný provoz od 1. února 2027). Týká se plateb přijatých při osobním kontaktu se zákazníkem: hotovost, karta, QR kód, stravenky. Bezhotovostní převody na dálku, platební brány a QR platby v e-shopu pod ni nespadají. OSVČ, která fakturuje a dostává zaplaceno převodem, se EET 2.0 většinou netýká. Pokud berete kartu nebo hotovost osobně, potřebujete nástroj s podporou EET 2.0, nebo bezplatnou státní aplikaci MOJE EET, která má být k dispozici od 1. prosince 2026.

3. Jste plátce DPH a máte klienty v EU?

Neplátce zajímá hlavně daňové přiznání k dani z příjmů a přehledy pro ČSSZ a zdravotní pojišťovnu. Plátce DPH potřebuje přiznání k DPH, kontrolní hlášení a při fakturaci firmám v EU i souhrnné hlášení. Prodej spotřebitelům v EU přidává OSS. Hlídejte si i limit pro registraci k DPH. Většina nástrojů tady exportuje ISDOC, český formát elektronické faktury. Peppol je důležitý, pokud fakturujete slovenským klientům, protože na Slovensku bude e-fakturace přes Peppol povinná od 1. ledna 2027.

4. V čem pracuje vaše účetní?

Pokud vaše účetní používá POHODU nebo Money S3, nástroj s čistým exportem do jejího programu (nebo od stejného výrobce) jí ušetří čas a vám peníze.

5. Umí párovat platby s vaší bankou?

Většina českých fakturačních programů páruje platby přes e-mailové notifikace z banky a seznam podporovaných bank se liší. Pokud máte mBank, dívejte se pozorně: Fakturoid ani iDoklad ji nepodporují.

6. Co se stane, až porostete?

Víc uživatelů, druhá firma nebo přechod na s.r.o. s podvojným účetnictvím. Sledujte cenu za uživatele a jestli jde mít víc firem v jednom účtu. Pokud uvažujete, jestli by se vám vyplatilo s.r.o., ověřte si i exporty do plnohodnotného účetního programu.

Srovnávací tabulka

Ceny bez DPH podle webů poskytovatelů v říjnu 2026 (Vyfakturuj u hlavních cen neuvádí, zda jsou s DPH, nebo bez; MoneySky má ceny v eurech). Před rozhodnutím si je ověřte na jejich ceníku.

Nástroje jeden po druhém

Fakturoid

Nejvyladěnější český fakturační program, na trhu od roku 2009. Od tarifu Na lehko (164 Kč měsíčně) máte daňové přiznání k dani z příjmů s přehledem pro ČSSZ, průběžný odhad sociálního a zdravotního pojištění a hlídání paušální daně i limitu DPH. Párování plateb začíná v Na každý den (231 Kč) a podporuje většinu českých bank i Fio API. MCP server zdarma, API ve všech tarifech a exporty do sedmi účetních programů z něj dělají volbu pro vývojáře. Podporu EET 2.0 ohlásil pro všechny placené tarify, zatím neběží. Nové firmy (IČO mladší 12 měsíců) mají 50% slevu na první roční fakturu.

Slabiny: přiznání k DPH, kontrolní hlášení, souhrnné hlášení a OSS jsou jen v Na maximum (429 Kč). Další uživatelé se platí zvlášť. Nepodporuje mBank. Cenové nabídky jsou jen v nejvyšším tarifu.

Nejlepší pro: OSVČ, kterým klienti platí převodem, a každého, kdo chce automatizovat. Viz ceník Fakturoidu.

iDoklad

Od společnosti Seyfor, která stojí za Money S3. Uživatelé jsou v ceně (podle tarifu 2, 5 nebo 9) a tarif Oblíbený (358 Kč měsíčně při roční platbě) přináší párování plateb, prodejky, přiznání k DPH, kontrolní hlášení a podklady pro daň z příjmů. Od Základního se propojuje s Money S3, S4, S5, Pohodou a Variem. AI Inbox vytěžuje přijaté doklady. Zkušební doba je 60 dní a bez karty.

Slabiny: párování a daňové výstupy až od Oblíbeného. Žádná sleva pro začínající podnikatele, žádná zmínka o Peppolu, k říjnu 2026 jsem nenašel oznámení o EET 2.0, chybí MCP server.

Nejlepší pro: malé týmy a firmy, jejichž účetní používá Money. Viz ceník iDokladu.

Vyfakturuj

Tarify jsou uvedeny za 175 Kč (Mini), 299 Kč (Ideal) a 620 Kč měsíčně za tři firmy (Profi). Z ceníku to vypadá na ceny bez DPH při roční platbě, ale výslovně to tam napsané není. Největší tahák je sleva pro začínající: 80 % z prvního ročního předplatného, pokud je IČO mladší 24 měsíců. Párování plateb začíná v Mini a od Ideal můžete přijímat platby kartou přes GoPay, Stripe, PayPal, Comgate a další. Exportuje do Pohody, Money S3 a DUELu a připraví částečně předvyplněná data k DPH pro MOJE daně.

Slabiny: nezmiňuje daň z příjmů, přehledy ani Peppol, oznámení o EET 2.0 jsem nenašel. Fio API je jen v Profi.

Nejlepší pro: podnikatele v prvních dvou letech a každého, kdo chce, aby klienti platili faktury kartou online.

SuperFaktura

Nejlevnější placený tarif s párováním plateb: Základní za 129 Kč měsíčně bez DPH. Nabízí i pololetní a roční platbu, ale roční cenu ceník přesně neuvádí. V seznamu bank má mBank, Revolut a Equu, které většině konkurence chybí, i když způsob párování se podle banky liší. Přiznání k DPH, kontrolní hlášení a souhrnné hlášení začínají ve Standardním tarifu (279 Kč). Slovenská verze uvádí odesílání i příjem faktur přes Peppol.

Slabiny: jeden uživatel plus účetní až do Prémiového tarifu (469 Kč), API jen v Prémiovém, daň z příjmů ani přehledy nezmiňuje, oznámení o EET 2.0 jsem nenašel, česká verze o Peppolu mlčí.

Nejlepší pro: napjatý rozpočet, klienty mBank nebo Revolutu a firmy se slovenskými zákazníky. Viz ceník SuperFaktury.

mPOHODA a POHODA Mini

mPOHODA je cloudová fakturace od Stormware. Start je zdarma v limitech (5 kontaktů, 100 vydaných faktur), Basic stojí 199 Kč měsíčně nebo 1 990 Kč ročně a Pro přidává 5 uživatelů a API. Propojení s bankou funguje s jakoukoli bankou přes Everifin, plus přímo s Fio. POHODA Mini je desktopová varianta: licence 2 980 Kč a 980 Kč ročně za aktualizace, pokrývá daňovou evidenci, fakturaci, přiznání k DPH, souhrnné hlášení a podklady pro daň z příjmů. Stormware potvrdil podporu EET 2.0 ve všech variantách POHODY a k tomu aplikaci mKasa zdarma.

Slabiny: POHODA Mini nemá homebanking, cizí měny ani majetek. Desktopová cesta je těžkopádnější než webová aplikace. Viz ceník mPOHODY.

Nejlepší pro: každého, jehož účetní používá Pohodu, a pro ty, kdo berou platby osobně a chtějí potvrzenou podporu EET 2.0.

Money S3 Basic

Desktopový program pro daňovou evidenci: licence 2 990 Kč a 1 690 Kč ročně za aktualizace (v roce nákupu zdarma). Má nejširší daňové pokrytí v tomto srovnání: přiznání k DPH včetně OSS, kontrolní hlášení, souhrnné hlášení, daňové přiznání k dani z příjmů a oba přehledy, s elektronickým podáním. Homebanking, majetek a kniha jízd jsou součástí.

Slabiny: paušální daň nezmiňuje, přístup z cloudu stojí 950 Kč za uživatele měsíčně a oznámení o EET 2.0, Peppolu ani AI jsem nenašel. Je to hlavně účetní program, takže fakturace je méně pohodlná než ve webových aplikacích.

Nejlepší pro: OSVČ se skutečnými výdaji, které chtějí všechny formuláře v jednom programu.

MoneySky

Webová aplikace, která spojuje fakturaci s propojením všech vašich účtů, podnikových i osobních. Napojí se na více než 2 686 bank v EU, EHP a Velké Británii přes PSD2 (včetně mBank), automaticky páruje platby faktur a každou fakturu stáhnete jako ISDOC i Peppol UBL. Na daňové straně srovná paušální výdaje, skutečné výdaje a paušální daň a připraví přiznání k DPH, daňové přiznání k dani z příjmů i přehledy. V jednom účtu můžete bez příplatku vést OSVČ i s.r.o. Jeden tarif za 7,99 € měsíčně nebo 79,90 € ročně (zhruba 200 Kč měsíčně).

Slabiny: žádná verze zdarma, žádné cenové nabídky ani prodejky, žádní další uživatelé pro tým, žádné nativní mobilní aplikace (do telefonu se přidá jako webová aplikace), žádný klientský platební portál ani platba kartou z faktury, žádné odesílání přes síť Peppol a žádná podpora EET 2.0 pro platby osobně. Je mladší, s menší uživatelskou základnou, a není to software pro podvojné účetnictví.

Nejlepší pro: OSVČ, které mají smíchané osobní a podnikové peníze a chtějí fakturaci, banky i daně OSVČ na jednom místě.

Rychlý výběr

• OSVČ sama za sebe, platby převodem: Fakturoid.
• Začínající podnikatel: Vyfakturuj (80 % z prvního roku, IČO do 24 měsíců) nebo Fakturoid (50 %, do 12 měsíců).
• Malý tým: iDoklad.
• Účetní používá Money S3: iDoklad, nebo Money S3 Basic, pokud si chcete evidenci vést sami.
• Účetní používá Pohodu: mPOHODA nebo POHODA Mini.
• Platby kartou nebo hotově osobně: POHODA (EET 2.0 potvrzeno) nebo Fakturoid (ohlášeno).
• Nízký rozpočet s párováním plateb: SuperFaktura.
• Vývojář, který chce automatizovat: Fakturoid.
• Faktury, všechny účty a daňové plánování dohromady: MoneySky.
• Přechod na podvojné účetnictví: program vaší účetní; ABRA Flexi Basic má podvojné účetnictví a uvádí 390 až 425 Kč za uživatele měsíčně.

Časté otázky

Existuje fakturační program zdarma pro OSVČ?

Ano. Fakturoid, iDoklad, Vyfakturuj, SuperFaktura i mPOHODA mají verze zdarma, obvykle omezené zhruba na pět odběratelů nebo kontaktů. Na občasnou fakturaci stačí. Párování plateb a daňové výstupy potřebují placený tarif.

Potřebuju jako OSVČ účetní program?

Ne nutně. S paušálními výdaji nebo paušální daní většinou stačí fakturační program, který eviduje příjmy. Pokud uplatňujete skutečné výdaje, potřebujete daňovou evidenci, kterou zvládne POHODA, Money S3 nebo dobrý fakturační program s evidencí nákladů. Podvojné účetnictví je hlavně pro firmy.

Který fakturační program podporuje EET 2.0?

K říjnu 2026 má EET 2.0 potvrzené Stormware pro všechny varianty POHODY, Fakturoid ji ohlásil pro všechny placené tarify (zatím neběží) a ABRA Flexi ji připravuje. Od iDokladu, Vyfakturuj, SuperFaktury ani Money S3 jsem oznámení nenašel. Pokud vám klienti platí jen převodem, EET 2.0 se vás většinou netýká.

Co je ISDOC?

ISDOC je český standard elektronické faktury: formát XML, často vložený přímo do PDF, který si účetní program vašeho klienta načte bez přepisování. Exportují ho Fakturoid, Vyfakturuj, SuperFaktura, POHODA i MoneySky a iDoklad přijaté doklady ISDOC čte automaticky.

V daňové kalkulačce pro OSVČ zjistíte, kolik vám z fakturace zůstane po zdanění. Pokud vám MoneySky dává smysl, můžete si ho 14 dní vyzkoušet zdarma, bez platební karty.